Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 MYL6-205ENST00000546845 452 ntTSL 36.75□□□□□ -1.333e-9■■■■■ 50.5
SUB1P53999 MRPL47-203ENST00000476781 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 50.5
SUB1P53999 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 50.5
SUB1P53999 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-205ENST00000504789 570 ntTSL 414.57□□□□□ -0.082e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-213ENST00000515355 771 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.8□□□□□ -12e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-209ENST00000511615 1658 ntTSL 1 (best)7.7□□□□□ -1.182e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-201ENST00000265073 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.292e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-204ENST00000504016 509 ntTSL 32.29□□□□□ -2.042e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.172e-25■■■■■ 50.5
SUB1P53999 ACADM-211ENST00000528016 546 ntTSL 412.9□□□□□ -0.342e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 ACADM-205ENST00000481374 666 ntTSL 33.45□□□□□ -1.862e-6■■■■■ 50.4
SUB1P53999 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.42e-9■■■■■ 50.3
SUB1P53999 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.512e-9■■■■■ 50.3
SUB1P53999 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-18■■■■■ 50.3
SUB1P53999 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-18■■■■■ 50.3
SUB1P53999 UBE2E1-203ENST00000424381 1224 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.262e-18■■■■■ 50.3
SUB1P53999 UBE2E1-205ENST00000452012 1166 ntTSL 34.85□□□□□ -1.632e-18■■■■■ 50.3
SUB1P53999 BCAT1-205ENST00000539282 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.96e-17■■■■■ 50.2
SUB1P53999 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.396e-17■■■■■ 50.2
SUB1P53999 BCAT1-207ENST00000543099 568 ntTSL 42.5□□□□□ -2.016e-17■■■■■ 50.2
SUB1P53999 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.98e-10■■■■■ 50.2
SUB1P53999 TOP2A-202ENST00000577541 420 ntTSL 21.14□□□□□ -2.238e-10■■■■■ 50.2
SUB1P53999 EFTUD2-214ENST00000589769 689 ntTSL 312.04□□□□□ -0.481e-10■■■■■ 49.8
SUB1P53999 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.952e-9■■■■■ 49.7
SUB1P53999 GUSB-205ENST00000447929 1983 ntTSL 320.15■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 49.7
SUB1P53999 GUSB-203ENST00000430730 1859 ntTSL 519.52■□□□□ 0.712e-9■■■■■ 49.7
SUB1P53999 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-9■■■■■ 49.7
SUB1P53999 GUSB-209ENST00000466883 2555 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-9■■■■■ 49.7
SUB1P53999 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-10■■■■■ 49.7
SUB1P53999 EIF2B2-201ENST00000266126 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.87e-10■■■■■ 49.7
SUB1P53999 EIF2B2-207ENST00000556668 1011 ntTSL 26.31□□□□□ -1.47e-10■■■■■ 49.7
SUB1P53999 KDM1A-203ENST00000465864 568 ntTSL 56.25□□□□□ -1.417e-9■■■■■ 49.7
SUB1P53999 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 05e-9■■■■■ 49.6
SUB1P53999 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 312.34□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 49.6
SUB1P53999 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.626e-9■■■■■ 49.6
SUB1P53999 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.856e-9■■■■■ 49.6
SUB1P53999 RPL35A-203ENST00000439255 564 ntTSL 55.17□□□□□ -1.586e-9■■■■■ 49.6
SUB1P53999 RPL35A-202ENST00000429437 442 ntTSL 53.66□□□□□ -1.826e-9■■■■■ 49.6
SUB1P53999 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.071e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-204ENST00000537407 1195 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.11e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.341e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.391e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-206ENST00000540962 793 ntTSL 211.92□□□□□ -0.51e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-209ENST00000543699 1001 ntTSL 511.84□□□□□ -0.511e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.541e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-203ENST00000535293 1773 ntTSL 310.69□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.711e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-210ENST00000544254 1481 ntTSL 210.44□□□□□ -0.741e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.791e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.851e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.911e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-202ENST00000361485 2087 ntTSL 28.98□□□□□ -0.971e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 AC069503.2-202ENST00000544911 1361 ntTSL 27.95□□□□□ -1.141e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 AP002748.4-201ENST00000419755 3547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.171e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 PSMD9-211ENST00000544724 3051 ntTSL 27.48□□□□□ -1.211e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 ANKHD1-EIF4EBP3-201ENST00000437495 2243 ntTSL 56.95□□□□□ -1.31e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 ANKHD1-210ENST00000432301 3234 ntTSL 1 (best)6.37□□□□□ -1.391e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.451e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 ANKHD1-212ENST00000435794 3511 ntTSL 55.93□□□□□ -1.461e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 ANKHD1-209ENST00000431508 4079 ntTSL 25.52□□□□□ -1.531e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 ANKHD1-EIF4EBP3-202ENST00000474060 5446 ntTSL 25.4□□□□□ -1.551e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 ANKHD1-211ENST00000433049 3649 ntTSL 55.01□□□□□ -1.611e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.631e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.71e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 SMG8-206ENST00000582469 1144 ntTSL 53.45□□□□□ -1.861e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 WDR12-204ENST00000467777 482 ntTSL 23.39□□□□□ -1.871e-10■■■■■ 49.5
SUB1P53999 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.388e-10■■■■■ 49.3
SUB1P53999 KYAT3-201ENST00000260508 2070 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 49.3
SUB1P53999 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.671e-7■■■■■ 49.3
SUB1P53999 KYAT3-204ENST00000446900 1937 ntTSL 51.62□□□□□ -2.151e-7■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.071e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-204ENST00000425198 6952 ntTSL 55.75□□□□□ -1.491e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.641e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.021e-8■■■■■ 49.3
SUB1P53999 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 49.2
SUB1P53999 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)6.24□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 49.2
SUB1P53999 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 49.2
SUB1P53999 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.712e-6■■■■■ 49.2
SUB1P53999 SRSF7-201ENST00000313117 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.018e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-206ENST00000431066 1847 ntTSL 58.68□□□□□ -1.028e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-208ENST00000443213 1903 ntTSL 58.29□□□□□ -1.088e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-209ENST00000446327 2453 ntTSL 2 BASIC8.2□□□□□ -1.18e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-205ENST00000425941 1944 ntTSL 57.93□□□□□ -1.148e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-204ENST00000425778 2857 ntTSL 26.87□□□□□ -1.318e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.528e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-207ENST00000432873 603 ntTSL 33.01□□□□□ -1.938e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-211ENST00000477635 680 ntTSL 22.48□□□□□ -2.018e-32■■■■■ 49
SUB1P53999 SRSF7-210ENST00000452806 747 ntTSL 21.68□□□□□ -2.148e-32■■■■■ 49
Retrieved 100 of 11,644 protein–RNA pairs in 227.6 ms