Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PGGT1BP53609 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PGGT1BP53609 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGGT1BP53609 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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