Protein–RNA interactions for Protein: P49918

CDKN1C, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1CP49918 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDKN1CP49918 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDKN1CP49918 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN1CP49918 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN1CP49918 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms