Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA2P48052 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA2P48052 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA2P48052 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CPA2P48052 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA2P48052 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA2P48052 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA2P48052 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA2P48052 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CPA2P48052 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA2P48052 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA2P48052 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA2P48052 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA2P48052 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA2P48052 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA2P48052 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CPA2P48052 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA2P48052 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA2P48052 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA2P48052 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA2P48052 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CPA2P48052 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPA2P48052 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPA2P48052 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPA2P48052 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPA2P48052 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPA2P48052 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CPA2P48052 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPA2P48052 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CPA2P48052 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CPA2P48052 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CPA2P48052 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CPA2P48052 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPA2P48052 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPA2P48052 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPA2P48052 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPA2P48052 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CPA2P48052 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPA2P48052 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPA2P48052 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPA2P48052 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CPA2P48052 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA2P48052 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA2P48052 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA2P48052 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA2P48052 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA2P48052 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CPA2P48052 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA2P48052 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA2P48052 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA2P48052 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA2P48052 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA2P48052 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA2P48052 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA2P48052 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CPA2P48052 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA2P48052 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA2P48052 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA2P48052 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA2P48052 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA2P48052 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA2P48052 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CPA2P48052 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA2P48052 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA2P48052 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA2P48052 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA2P48052 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA2P48052 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA2P48052 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA2P48052 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CPA2P48052 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CPA2P48052 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms