Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
IQGAP1P46940 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
IQGAP1P46940 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.84■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
IQGAP1P46940 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
IQGAP1P46940 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
IQGAP1P46940 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
IQGAP1P46940 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
IQGAP1P46940 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
IQGAP1P46940 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
IQGAP1P46940 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
IQGAP1P46940 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
IQGAP1P46940 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms