Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP13P45452 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MMP13P45452 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP13P45452 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP13P45452 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP13P45452 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MMP13P45452 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP13P45452 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MMP13P45452 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP13P45452 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP13P45452 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MMP13P45452 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP13P45452 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP13P45452 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP13P45452 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MMP13P45452 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP13P45452 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP13P45452 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP13P45452 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MMP13P45452 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP13P45452 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP13P45452 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP13P45452 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP13P45452 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP13P45452 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP13P45452 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP13P45452 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MMP13P45452 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP13P45452 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP13P45452 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP13P45452 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP13P45452 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP13P45452 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP13P45452 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MMP13P45452 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP13P45452 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP13P45452 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP13P45452 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP13P45452 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP13P45452 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP13P45452 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MMP13P45452 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP13P45452 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP13P45452 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP13P45452 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP13P45452 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP13P45452 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MMP13P45452 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP13P45452 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP13P45452 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP13P45452 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MMP13P45452 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP13P45452 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP13P45452 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP13P45452 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MMP13P45452 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP13P45452 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP13P45452 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP13P45452 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP13P45452 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MMP13P45452 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP13P45452 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP13P45452 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MMP13P45452 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP13P45452 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP13P45452 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP13P45452 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP13P45452 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP13P45452 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP13P45452 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP13P45452 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP13P45452 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP13P45452 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MMP13P45452 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP13P45452 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP13P45452 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP13P45452 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP13P45452 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP13P45452 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP13P45452 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP13P45452 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP13P45452 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP13P45452 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP13P45452 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP13P45452 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP13P45452 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP13P45452 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP13P45452 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms