Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP214P35658 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP214P35658 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP214P35658 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP214P35658 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP214P35658 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP214P35658 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP214P35658 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP214P35658 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP214P35658 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP214P35658 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP214P35658 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP214P35658 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP214P35658 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP214P35658 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP214P35658 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP214P35658 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP214P35658 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP214P35658 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP214P35658 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP214P35658 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP214P35658 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP214P35658 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP214P35658 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP214P35658 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP214P35658 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP214P35658 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP214P35658 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP214P35658 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP214P35658 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP214P35658 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP214P35658 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP214P35658 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP214P35658 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP214P35658 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP214P35658 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP214P35658 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP214P35658 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP214P35658 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP214P35658 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP214P35658 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP214P35658 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NUP214P35658 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP214P35658 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP214P35658 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NUP214P35658 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NUP214P35658 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP214P35658 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP214P35658 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP214P35658 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP214P35658 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP214P35658 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NUP214P35658 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP214P35658 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP214P35658 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP214P35658 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NUP214P35658 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NUP214P35658 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP214P35658 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP214P35658 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP214P35658 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP214P35658 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP214P35658 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP214P35658 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP214P35658 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NUP214P35658 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms