Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA9P31269 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA9P31269 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HOXA9P31269 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXA9P31269 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA9P31269 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 216.2 ms