Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SSFA2P28290 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
SSFA2P28290 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SSFA2P28290 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SSFA2P28290 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SSFA2P28290 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms