Protein–RNA interactions for Protein: P20309

CHRM3, Muscarinic acetylcholine receptor M3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRM3P20309 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHRM3P20309 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRM3P20309 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRM3P20309 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRM3P20309 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms