Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLR2CP19387 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLR2CP19387 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLR2CP19387 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms