Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF7P17544 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF7P17544 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF7P17544 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATF7P17544 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF7P17544 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF7P17544 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF7P17544 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF7P17544 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF7P17544 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATF7P17544 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF7P17544 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATF7P17544 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATF7P17544 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7P17544 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7P17544 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7P17544 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATF7P17544 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7P17544 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7P17544 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7P17544 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATF7P17544 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7P17544 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7P17544 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATF7P17544 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATF7P17544 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7P17544 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7P17544 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7P17544 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7P17544 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7P17544 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7P17544 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7P17544 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATF7P17544 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF7P17544 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF7P17544 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF7P17544 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF7P17544 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF7P17544 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATF7P17544 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF7P17544 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF7P17544 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF7P17544 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATF7P17544 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF7P17544 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF7P17544 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF7P17544 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF7P17544 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF7P17544 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF7P17544 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF7P17544 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATF7P17544 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF7P17544 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF7P17544 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF7P17544 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF7P17544 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF7P17544 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATF7P17544 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
ATF7P17544 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF7P17544 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATF7P17544 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF7P17544 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF7P17544 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF7P17544 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATF7P17544 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF7P17544 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF7P17544 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF7P17544 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF7P17544 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF7P17544 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATF7P17544 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATF7P17544 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF7P17544 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF7P17544 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF7P17544 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF7P17544 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ATF7P17544 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF7P17544 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF7P17544 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF7P17544 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF7P17544 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF7P17544 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF7P17544 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF7P17544 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF7P17544 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF7P17544 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF7P17544 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF7P17544 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF7P17544 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF7P17544 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms