Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF28P17035 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF28P17035 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNF28P17035 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNF28P17035 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms