Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
STMN1P16949 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STMN1P16949 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
STMN1P16949 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STMN1P16949 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN1P16949 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN1P16949 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN1P16949 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN1P16949 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
STMN1P16949 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STMN1P16949 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
STMN1P16949 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STMN1P16949 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN1P16949 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN1P16949 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN1P16949 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN1P16949 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN1P16949 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN1P16949 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN1P16949 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STMN1P16949 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
STMN1P16949 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STMN1P16949 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
STMN1P16949 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STMN1P16949 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STMN1P16949 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STMN1P16949 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STMN1P16949 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
STMN1P16949 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STMN1P16949 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STMN1P16949 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMN1P16949 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMN1P16949 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMN1P16949 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMN1P16949 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMN1P16949 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STMN1P16949 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMN1P16949 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMN1P16949 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMN1P16949 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMN1P16949 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMN1P16949 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMN1P16949 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STMN1P16949 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMN1P16949 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMN1P16949 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMN1P16949 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMN1P16949 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMN1P16949 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STMN1P16949 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms