Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FDPSP14324 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FDPSP14324 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
FDPSP14324 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FDPSP14324 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
FDPSP14324 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FDPSP14324 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FDPSP14324 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FDPSP14324 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FDPSP14324 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FDPSP14324 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FDPSP14324 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FDPSP14324 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FDPSP14324 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FDPSP14324 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FDPSP14324 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FDPSP14324 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FDPSP14324 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FDPSP14324 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FDPSP14324 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FDPSP14324 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FDPSP14324 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FDPSP14324 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FDPSP14324 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FDPSP14324 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FDPSP14324 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FDPSP14324 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FDPSP14324 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FDPSP14324 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FDPSP14324 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FDPSP14324 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FDPSP14324 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FDPSP14324 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FDPSP14324 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FDPSP14324 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FDPSP14324 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
FDPSP14324 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FDPSP14324 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FDPSP14324 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FDPSP14324 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FDPSP14324 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FDPSP14324 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
FDPSP14324 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
FDPSP14324 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FDPSP14324 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FDPSP14324 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FDPSP14324 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FDPSP14324 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FDPSP14324 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FDPSP14324 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FDPSP14324 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FDPSP14324 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FDPSP14324 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FDPSP14324 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FDPSP14324 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FDPSP14324 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FDPSP14324 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FDPSP14324 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FDPSP14324 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FDPSP14324 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FDPSP14324 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FDPSP14324 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FDPSP14324 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FDPSP14324 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FDPSP14324 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FDPSP14324 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FDPSP14324 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FDPSP14324 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
FDPSP14324 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FDPSP14324 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FDPSP14324 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FDPSP14324 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FDPSP14324 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FDPSP14324 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FDPSP14324 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FDPSP14324 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FDPSP14324 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FDPSP14324 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FDPSP14324 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FDPSP14324 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FDPSP14324 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FDPSP14324 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FDPSP14324 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FDPSP14324 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FDPSP14324 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FDPSP14324 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FDPSP14324 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FDPSP14324 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms