Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARGP13631 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARGP13631 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARGP13631 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RARGP13631 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARGP13631 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARGP13631 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARGP13631 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RARGP13631 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RARGP13631 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARGP13631 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARGP13631 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARGP13631 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARGP13631 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARGP13631 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARGP13631 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RARGP13631 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RARGP13631 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RARGP13631 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARGP13631 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RARGP13631 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RARGP13631 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARGP13631 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARGP13631 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARGP13631 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RARGP13631 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RARGP13631 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARGP13631 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARGP13631 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARGP13631 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RARGP13631 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARGP13631 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RARGP13631 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARGP13631 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARGP13631 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RARGP13631 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARGP13631 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARGP13631 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RARGP13631 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARGP13631 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RARGP13631 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARGP13631 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARGP13631 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RARGP13631 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARGP13631 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RARGP13631 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARGP13631 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARGP13631 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARGP13631 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RARGP13631 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARGP13631 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARGP13631 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARGP13631 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARGP13631 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARGP13631 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RARGP13631 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARGP13631 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARGP13631 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARGP13631 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RARGP13631 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RARGP13631 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARGP13631 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARGP13631 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RARGP13631 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARGP13631 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RARGP13631 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARGP13631 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARGP13631 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARGP13631 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARGP13631 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARGP13631 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RARGP13631 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RARGP13631 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARGP13631 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARGP13631 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARGP13631 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARGP13631 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARGP13631 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARGP13631 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARGP13631 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RARGP13631 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RARGP13631 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARGP13631 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RARGP13631 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARGP13631 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARGP13631 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RARGP13631 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARGP13631 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARGP13631 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARGP13631 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RARGP13631 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms