Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAMP1P11279 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAMP1P11279 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms