Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C8orf89P0DMQ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C8orf89P0DMQ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C8orf89P0DMQ9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C8orf89P0DMQ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms