Protein–RNA interactions for Protein: P0DKV0

SPATA31C1, Spermatogenesis-associated protein 31C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA31C1P0DKV0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPATA31C1P0DKV0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPATA31C1P0DKV0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SPATA31C1P0DKV0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SPATA31C1P0DKV0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms