Protein–RNA interactions for Protein: P09543

CNP, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPP09543 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNPP09543 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNPP09543 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNPP09543 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CNPP09543 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPP09543 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPP09543 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPP09543 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPP09543 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPP09543 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPP09543 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPP09543 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CNPP09543 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNPP09543 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNPP09543 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CNPP09543 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CNPP09543 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CNPP09543 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CNPP09543 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNPP09543 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNPP09543 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNPP09543 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CNPP09543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNPP09543 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNPP09543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNPP09543 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CNPP09543 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CNPP09543 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CNPP09543 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNPP09543 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNPP09543 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CNPP09543 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CNPP09543 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPP09543 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPP09543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPP09543 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPP09543 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPP09543 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPP09543 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CNPP09543 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPP09543 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPP09543 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPP09543 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CNPP09543 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPP09543 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPP09543 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPP09543 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPP09543 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CNPP09543 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNPP09543 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNPP09543 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CNPP09543 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CNPP09543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPP09543 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPP09543 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPP09543 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPP09543 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPP09543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPP09543 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CNPP09543 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPP09543 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPP09543 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPP09543 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPP09543 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNPP09543 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPP09543 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPP09543 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPP09543 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPP09543 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPP09543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNPP09543 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPP09543 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPP09543 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPP09543 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPP09543 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPP09543 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPP09543 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNPP09543 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPP09543 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPP09543 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPP09543 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPP09543 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNPP09543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPP09543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPP09543 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPP09543 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPP09543 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPP09543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPP09543 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNPP09543 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms