Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPSP04118 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPSP04118 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPSP04118 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPSP04118 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPSP04118 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPSP04118 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPSP04118 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPSP04118 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPSP04118 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPSP04118 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPSP04118 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPSP04118 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLPSP04118 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPSP04118 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPSP04118 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPSP04118 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPSP04118 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPSP04118 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPSP04118 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPSP04118 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPSP04118 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPSP04118 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPSP04118 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPSP04118 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPSP04118 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPSP04118 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPSP04118 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPSP04118 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPSP04118 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPSP04118 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPSP04118 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPSP04118 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPSP04118 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPSP04118 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPSP04118 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPSP04118 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPSP04118 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPSP04118 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPSP04118 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPSP04118 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPSP04118 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPSP04118 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPSP04118 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPSP04118 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPSP04118 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPSP04118 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPSP04118 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPSP04118 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPSP04118 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLPSP04118 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPSP04118 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPSP04118 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPSP04118 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPSP04118 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLPSP04118 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPSP04118 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLPSP04118 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLPSP04118 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPSP04118 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPSP04118 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPSP04118 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPSP04118 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLPSP04118 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLPSP04118 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CLPSP04118 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPSP04118 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPSP04118 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPSP04118 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPSP04118 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPSP04118 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPSP04118 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPSP04118 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLPSP04118 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms