Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAF1P04049 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAF1P04049 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAF1P04049 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAF1P04049 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAF1P04049 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAF1P04049 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAF1P04049 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAF1P04049 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAF1P04049 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAF1P04049 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAF1P04049 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAF1P04049 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAF1P04049 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAF1P04049 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAF1P04049 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAF1P04049 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAF1P04049 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RAF1P04049 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAF1P04049 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAF1P04049 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RAF1P04049 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAF1P04049 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RAF1P04049 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAF1P04049 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAF1P04049 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAF1P04049 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAF1P04049 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAF1P04049 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAF1P04049 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAF1P04049 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAF1P04049 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAF1P04049 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAF1P04049 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAF1P04049 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAF1P04049 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAF1P04049 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAF1P04049 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAF1P04049 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAF1P04049 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAF1P04049 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAF1P04049 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAF1P04049 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAF1P04049 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAF1P04049 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAF1P04049 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAF1P04049 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAF1P04049 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAF1P04049 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAF1P04049 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAF1P04049 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAF1P04049 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAF1P04049 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAF1P04049 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAF1P04049 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAF1P04049 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAF1P04049 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAF1P04049 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAF1P04049 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAF1P04049 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAF1P04049 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAF1P04049 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAF1P04049 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAF1P04049 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAF1P04049 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAF1P04049 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms