Protein–RNA interactions for Protein: O96005

CLPTM1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1O96005 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLPTM1O96005 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLPTM1O96005 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLPTM1O96005 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLPTM1O96005 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms