Protein–RNA interactions for Protein: O95863

SNAI1, Zinc finger protein SNAI1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI1O95863 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNAI1O95863 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNAI1O95863 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNAI1O95863 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNAI1O95863 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 620.5 ms