Protein–RNA interactions for Protein: O95343

SIX3, Homeobox protein SIX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3O95343 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX3O95343 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SIX3O95343 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX3O95343 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX3O95343 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX3O95343 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SIX3O95343 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIX3O95343 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX3O95343 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX3O95343 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX3O95343 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX3O95343 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX3O95343 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX3O95343 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIX3O95343 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIX3O95343 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX3O95343 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX3O95343 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX3O95343 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX3O95343 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIX3O95343 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX3O95343 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX3O95343 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX3O95343 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX3O95343 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SIX3O95343 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX3O95343 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX3O95343 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SIX3O95343 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX3O95343 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX3O95343 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX3O95343 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX3O95343 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX3O95343 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX3O95343 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SIX3O95343 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX3O95343 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX3O95343 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX3O95343 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX3O95343 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX3O95343 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX3O95343 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SIX3O95343 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX3O95343 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX3O95343 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX3O95343 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SIX3O95343 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX3O95343 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX3O95343 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX3O95343 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX3O95343 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX3O95343 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SIX3O95343 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX3O95343 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX3O95343 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX3O95343 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX3O95343 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX3O95343 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX3O95343 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SIX3O95343 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX3O95343 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX3O95343 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX3O95343 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SIX3O95343 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms