Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRATO95237 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRATO95237 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRATO95237 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRATO95237 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRATO95237 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRATO95237 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRATO95237 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRATO95237 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRATO95237 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRATO95237 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRATO95237 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRATO95237 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRATO95237 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRATO95237 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRATO95237 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRATO95237 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRATO95237 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRATO95237 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRATO95237 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRATO95237 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRATO95237 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRATO95237 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRATO95237 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRATO95237 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRATO95237 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRATO95237 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRATO95237 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRATO95237 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRATO95237 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRATO95237 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRATO95237 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRATO95237 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRATO95237 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRATO95237 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRATO95237 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRATO95237 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRATO95237 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRATO95237 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRATO95237 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRATO95237 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRATO95237 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRATO95237 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRATO95237 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRATO95237 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRATO95237 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRATO95237 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRATO95237 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRATO95237 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRATO95237 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRATO95237 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRATO95237 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRATO95237 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRATO95237 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRATO95237 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRATO95237 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRATO95237 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
LRATO95237 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRATO95237 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRATO95237 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRATO95237 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRATO95237 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRATO95237 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRATO95237 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRATO95237 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRATO95237 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRATO95237 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRATO95237 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LRATO95237 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRATO95237 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRATO95237 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRATO95237 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRATO95237 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRATO95237 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRATO95237 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRATO95237 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRATO95237 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRATO95237 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRATO95237 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LRATO95237 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRATO95237 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRATO95237 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRATO95237 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRATO95237 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRATO95237 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRATO95237 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
LRATO95237 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRATO95237 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRATO95237 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms