Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSPAN2O60636 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSPAN2O60636 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms