Protein–RNA interactions for Protein: O60635

TSPAN1, Tetraspanin-1, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1O60635 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TSPAN1O60635 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TSPAN1O60635 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TSPAN1O60635 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSPAN1O60635 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms