Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEMFO60524 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEMFO60524 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEMFO60524 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEMFO60524 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEMFO60524 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEMFO60524 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEMFO60524 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEMFO60524 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEMFO60524 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEMFO60524 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEMFO60524 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEMFO60524 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEMFO60524 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEMFO60524 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEMFO60524 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEMFO60524 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NEMFO60524 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEMFO60524 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEMFO60524 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEMFO60524 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEMFO60524 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEMFO60524 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEMFO60524 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEMFO60524 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEMFO60524 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEMFO60524 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEMFO60524 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEMFO60524 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEMFO60524 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEMFO60524 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEMFO60524 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NEMFO60524 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEMFO60524 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEMFO60524 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEMFO60524 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEMFO60524 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEMFO60524 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NEMFO60524 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NEMFO60524 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEMFO60524 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NEMFO60524 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEMFO60524 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEMFO60524 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEMFO60524 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEMFO60524 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEMFO60524 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NEMFO60524 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEMFO60524 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEMFO60524 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEMFO60524 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NEMFO60524 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEMFO60524 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEMFO60524 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEMFO60524 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEMFO60524 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NEMFO60524 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NEMFO60524 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEMFO60524 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEMFO60524 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEMFO60524 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NEMFO60524 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NEMFO60524 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEMFO60524 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NEMFO60524 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEMFO60524 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEMFO60524 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEMFO60524 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEMFO60524 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEMFO60524 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEMFO60524 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEMFO60524 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NEMFO60524 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEMFO60524 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEMFO60524 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEMFO60524 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEMFO60524 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEMFO60524 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEMFO60524 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEMFO60524 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEMFO60524 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEMFO60524 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEMFO60524 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEMFO60524 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEMFO60524 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEMFO60524 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEMFO60524 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms