Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCO2O43819 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCO2O43819 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCO2O43819 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCO2O43819 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SCO2O43819 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCO2O43819 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCO2O43819 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCO2O43819 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SCO2O43819 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCO2O43819 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCO2O43819 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCO2O43819 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCO2O43819 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SCO2O43819 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCO2O43819 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCO2O43819 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SCO2O43819 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO2O43819 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCO2O43819 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCO2O43819 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCO2O43819 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCO2O43819 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SCO2O43819 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCO2O43819 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SCO2O43819 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCO2O43819 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SCO2O43819 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCO2O43819 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCO2O43819 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCO2O43819 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCO2O43819 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCO2O43819 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCO2O43819 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCO2O43819 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCO2O43819 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCO2O43819 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SCO2O43819 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SCO2O43819 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCO2O43819 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCO2O43819 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCO2O43819 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCO2O43819 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCO2O43819 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCO2O43819 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SCO2O43819 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCO2O43819 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SCO2O43819 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCO2O43819 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO2O43819 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO2O43819 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO2O43819 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO2O43819 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO2O43819 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO2O43819 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO2O43819 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO2O43819 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCO2O43819 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCO2O43819 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCO2O43819 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCO2O43819 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCO2O43819 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCO2O43819 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCO2O43819 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO2O43819 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO2O43819 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO2O43819 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO2O43819 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO2O43819 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO2O43819 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO2O43819 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO2O43819 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCO2O43819 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCO2O43819 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCO2O43819 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCO2O43819 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCO2O43819 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCO2O43819 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCO2O43819 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCO2O43819 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCO2O43819 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCO2O43819 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCO2O43819 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCO2O43819 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCO2O43819 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCO2O43819 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCO2O43819 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCO2O43819 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCO2O43819 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCO2O43819 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms