Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IFIT3O14879 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
IFIT3O14879 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
IFIT3O14879 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
IFIT3O14879 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms