Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE2CO00762 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
UBE2CO00762 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBE2CO00762 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms