Protein–RNA interactions for Protein: O00515

LAD1, Ladinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAD1O00515 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LAD1O00515 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LAD1O00515 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAD1O00515 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAD1O00515 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAD1O00515 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LAD1O00515 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAD1O00515 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LAD1O00515 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LAD1O00515 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LAD1O00515 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LAD1O00515 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LAD1O00515 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAD1O00515 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LAD1O00515 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LAD1O00515 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAD1O00515 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAD1O00515 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAD1O00515 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LAD1O00515 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LAD1O00515 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAD1O00515 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAD1O00515 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAD1O00515 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAD1O00515 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAD1O00515 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LAD1O00515 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAD1O00515 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAD1O00515 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAD1O00515 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAD1O00515 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAD1O00515 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LAD1O00515 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAD1O00515 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LAD1O00515 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAD1O00515 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAD1O00515 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LAD1O00515 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAD1O00515 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAD1O00515 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAD1O00515 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LAD1O00515 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAD1O00515 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LAD1O00515 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAD1O00515 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAD1O00515 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAD1O00515 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LAD1O00515 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LAD1O00515 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LAD1O00515 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAD1O00515 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAD1O00515 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LAD1O00515 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAD1O00515 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LAD1O00515 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LAD1O00515 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LAD1O00515 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAD1O00515 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAD1O00515 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LAD1O00515 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAD1O00515 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAD1O00515 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LAD1O00515 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms