Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EIF3FO00303 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF3FO00303 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EIF3FO00303 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EIF3FO00303 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms