Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
J3KR12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
J3KR12 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
J3KR12 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
J3KR12 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3KR12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3KR12 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3KR12 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3KR12 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3KR12 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3KR12 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3KR12 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3KR12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3KR12 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
J3KR12 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3KR12 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3KR12 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
J3KR12 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
J3KR12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
J3KR12 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
J3KR12 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
J3KR12 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
J3KR12 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
J3KR12 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
J3KR12 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
J3KR12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
J3KR12 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
J3KR12 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
J3KR12 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
J3KR12 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
J3KR12 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
J3KR12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
J3KR12 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
J3KR12 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
J3KR12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
J3KR12 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
J3KR12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
J3KR12 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
J3KR12 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
J3KR12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
J3KR12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
J3KR12 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
J3KR12 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
J3KR12 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
J3KR12 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
J3KR12 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
J3KR12 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3KR12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3KR12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3KR12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
J3KR12 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
J3KR12 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3KR12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3KR12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3KR12 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
J3KR12 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
J3KR12 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
J3KR12 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
J3KR12 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
J3KR12 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
J3KR12 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
J3KR12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
J3KR12 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
J3KR12 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
J3KR12 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms