Protein–RNA interactions for Protein: I3L0E3

hCG_1984214, HCG1984214, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
hCG_1984214I3L0E3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
hCG_1984214I3L0E3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
hCG_1984214I3L0E3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
hCG_1984214I3L0E3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
hCG_1984214I3L0E3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms