Protein–RNA interactions for Protein: H3BMM5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BMM5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BMM5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BMM5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BMM5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BMM5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BMM5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H3BMM5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BMM5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H3BMM5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BMM5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BMM5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BMM5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BMM5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H3BMM5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BMM5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BMM5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H3BMM5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H3BMM5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H3BMM5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BMM5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BMM5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BMM5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BMM5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BMM5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H3BMM5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BMM5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BMM5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BMM5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BMM5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BMM5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BMM5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BMM5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BMM5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BMM5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BMM5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BMM5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BMM5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BMM5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BMM5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BMM5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BMM5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BMM5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BMM5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BMM5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BMM5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BMM5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BMM5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BMM5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BMM5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BMM5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BMM5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BMM5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BMM5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BMM5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BMM5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BMM5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BMM5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BMM5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BMM5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BMM5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BMM5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BMM5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BMM5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BMM5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BMM5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BMM5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BMM5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BMM5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
H3BMM5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BMM5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BMM5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BMM5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BMM5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BMM5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BMM5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BMM5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BMM5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BMM5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BMM5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BMM5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BMM5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BMM5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BMM5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BMM5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BMM5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BMM5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BMM5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BMM5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms