Protein–RNA interactions for Protein: E9PMD0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PMD0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PMD0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
E9PMD0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PMD0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
E9PMD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PMD0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PMD0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PMD0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PMD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PMD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PMD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
E9PMD0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E9PMD0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E9PMD0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E9PMD0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E9PMD0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
E9PMD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
E9PMD0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E9PMD0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
E9PMD0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
E9PMD0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E9PMD0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
E9PMD0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
E9PMD0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
E9PMD0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
E9PMD0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E9PMD0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E9PMD0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E9PMD0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E9PMD0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E9PMD0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
E9PMD0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
E9PMD0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E9PMD0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E9PMD0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E9PMD0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E9PMD0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E9PMD0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E9PMD0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
E9PMD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
E9PMD0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
E9PMD0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E9PMD0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E9PMD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
E9PMD0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
E9PMD0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
E9PMD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PMD0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PMD0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PMD0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PMD0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
E9PMD0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
E9PMD0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
E9PMD0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
E9PMD0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
E9PMD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
E9PMD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PMD0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PMD0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PMD0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
E9PMD0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PMD0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PMD0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PMD0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
E9PMD0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PMD0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PMD0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PMD0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PMD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
E9PMD0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PMD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PMD0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PMD0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
E9PMD0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
E9PMD0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PMD0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
E9PMD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PMD0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PMD0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PMD0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PMD0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PMD0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PMD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PMD0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
E9PMD0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PMD0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PMD0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PMD0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
E9PMD0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PMD0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PMD0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
E9PMD0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms