Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CENPBD1B2RD01 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CENPBD1B2RD01 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPBD1B2RD01 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CENPBD1B2RD01 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms