Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCT8L1PA6NM43 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCT8L1PA6NM43 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCT8L1PA6NM43 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCT8L1PA6NM43 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms