Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0B3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0B3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A087X0B3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A087X0B3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087X0B3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087X0B3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087X0B3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087X0B3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.57■■■□□ 2
A0A087X0B3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A087X0B3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087X0B3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087X0B3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087X0B3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087X0B3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087X0B3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087X0B3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087X0B3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A087X0B3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087X0B3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087X0B3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A087X0B3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.55■■■□□ 2
A0A087X0B3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A087X0B3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A087X0B3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A087X0B3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087X0B3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087X0B3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A087X0B3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.52■■■□□ 2
A0A087X0B3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A087X0B3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms