Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WXM4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WXM4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WXM4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WXM4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A087WXM4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A087WXM4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms