Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6W3

CAPN7, Calpain-7, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7Q9Y6W3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN7Q9Y6W3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN7Q9Y6W3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN7Q9Y6W3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN7Q9Y6W3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms