Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5V3

MAGED1, Melanoma-associated antigen D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGED1Q9Y5V3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAGED1Q9Y5V3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MAGED1Q9Y5V3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGED1Q9Y5V3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGED1Q9Y5V3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGED1Q9Y5V3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MAGED1Q9Y5V3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MAGED1Q9Y5V3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MAGED1Q9Y5V3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAGED1Q9Y5V3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms