Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAPPC1Q9Y5R8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAPPC1Q9Y5R8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAPPC1Q9Y5R8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms