Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PCDHB4Q9Y5E5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCDHB4Q9Y5E5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PCDHB4Q9Y5E5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHB4Q9Y5E5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms