Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.21■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
RAD54L2Q9Y4B4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC42.19■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC42.16■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC42.15■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC42.15■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC42.14■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC42.14■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
RAD54L2Q9Y4B4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.11■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.1■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
RAD54L2Q9Y4B4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAD54L2Q9Y4B4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC41.99■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.98■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.96■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC41.93■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
RAD54L2Q9Y4B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RAD54L2Q9Y4B4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms