Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RCE1Q9Y256 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RCE1Q9Y256 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RCE1Q9Y256 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms