Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GINS2Q9Y248 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GINS2Q9Y248 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GINS2Q9Y248 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GINS2Q9Y248 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms