Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MID2Q9UJV3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MID2Q9UJV3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MID2Q9UJV3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MID2Q9UJV3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms